Visualisation of variable binding pockets on protein surfaces by probabilistic analysis of related structure sets
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Visualization of variable binding pockets on protein surfaces by probabilistic analysis of related structure sets
Background: Protein structures provide a valuable resource for rational drug design. For a protein with no known ligand, computational tools can predict surface pockets that are of suitable size and shape to accommodate a complementary small-molecule drug. However, pocket prediction against single static structures may miss features of pockets that arise from proteins’ dynamic behaviour. In par...
متن کاملDesigning Binding Pockets on Protein Surfaces using the A* Algorithm
The in-silico design of ligands binding to the protein surface instead of deep binding pockets is still a great challenge. Often no appropriate binding pockets are available in the apo experimental structures and standard virtual screening techniques will fail. Here, we present two new algorithms for designing tailored ligand binding pockets on the protein surface that account for protein backb...
متن کاملthe structure of lie derivations on c*-algebras
نشان می دهیم که هر اشتقاق لی روی یک c^*-جبر به شکل استاندارد است، یعنی می تواند به طور یکتا به مجموع یک اشتقاق لی و یک اثر مرکز مقدار تجزیه شود. کلمات کلیدی: اشتقاق، اشتقاق لی، c^*-جبر.
15 صفحه اولinvestigation of effective parameters on the rigidity of light composite diaphragms (psscb) by fem
در این رساله با معرفی سقف های psscb متشکل از ترکیب ورق های فولادی ذوزنقه ای و تخته های سیمانی الیافی به عنوان سقف های پیش ساخته (سازگار با سیستم سازه ای قاب های فولادی سبک) به بررسی پارامترهای موثر بر صلبیت سقف، پرداخته می شود. در تحقیق حاضر ابتدا به مدل سازی دو نمونه سقف آزمایش شده، به روش اجزاء محدود با استفاده از نرم افزار تحلیلی abaqus ver 6.10 پرداخته شده است. نمونه های ساخته شده تحت اعما...
: the effect of sericin levels (silk glue protein) on rate of in vitro maturation, fertilization and culture of sheep oocytes
هدف از آزمایش اول بررسی اثر سطوح مختلف سریسین [0 (control), 0.1, 0.5, 1.0, 2.5 %] افزوده شده به محیط , ivm بر cumulus cell expansion، بلوغ هسته و توسعه متوالی جنین، در گوسفندان نژاد سنجابی در فصل تولید مثلی می باشد. از سرگیری میوز به وسیله خارج شدن اولین پولار بادی اندازه گیری و هم چنین درصد رسیدن جنین های دو سلولی به مرحله کلیواژ و بلاستوسیت نیز به عنوان نشانه ای از میزان شایستگی توسعه اولیه ج...
ذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: BMC Bioinformatics
سال: 2012
ISSN: 1471-2105
DOI: 10.1186/1471-2105-13-39